ViewWiki

העולם, קצת יותר מקרוב

אנזימים.

לעסו לחם זמן מה, והוא יתחיל להיות מתוק. זו עבודתם של אנזימים, הזרזים החלבוניים של החיים, והם פועלים רק בטווח צר של חום.

גלו את הסצנה מאמר אינטראקטיבי

01 / הניסוי

הצורה הנכונה, החום הנכון.

חממו את הכוס מטמפרטורת המקרר אל טמפרטורת הגוף ומעבר לה, נסו pH אחר, וצפו בעקומת הפעילות עולה ויורדת.

תמונה של הסצנה התלת־ממדית „אנזימים”, שעוסקת בשאלה: למה האנזימים בגוף שלכם פועלים הכי טוב סביב 37 °C?
סצנה אינטראקטיבית

הגרסה האינטראקטיבית נטענת…

ההסבר שלמטה זמין כבר עכשיו, בזמן שהסצנה נטענת.

מלטאז, האנזים של המעי שמפרק מלטוז, סוכר בעל שתי טבעות, לשתי מולקולות גלוקוז, ובכל פעם קולט מולקולת מים אחת. כל גוף כחול הוא מלטאז אחד בקיפול שנמדד לו (רשומה 2QMJ ב־wwPDB, Sim ועמיתיו, 2008), והאתר הפעיל שלו בכתום.הסוכרים מצוירים בלי אטומי המימן, וגדולים בערך פי ארבעה ממה שהיו לצד האנזימים. העקומה אופיינית לאנזימים של האדם, ולא נמדדה למלטאז. קירור מקפל מחדש את האנזימים שבמודל; אנזימים אמיתיים בדרך כלל נשארים הרוסים.

02 / שלוש טמפרטורות

קר מדי, בדיוק נכון, הרוס.

החום מאיץ את התגובה, עד שהוא הורס את צורת האנזים.

בערך 4 °C01
הכוס הכימית ב־4 מעלות: שלושה אנזימי מלטאז מקופלים, בכחול בהיר, בין סוכרי מלטוז.

מקרר

האנזים שומר על צורתו, אבל המולקולות נעות בעצלתיים, ולכן פחות מהן מגיעות לאתר עם מספיק אנרגיה כדי להגיב.

צורה
מקופל
אתר פעיל
מתאים לסוכר
קצב
איטי
בערך 37 °C02
הכוס ב־37 מעלות: אותם אנזימים מקופלים, וכל אחד מחזיק סוכר מלטוז באתר הפעיל שלו.

חום הגוף

חם מספיק למפגשים תכופים ונמרצים, ועדיין קריר מספיק כדי שהקיפול יחזיק. האנזימים של האדם מכוונים לטמפרטורה הזאת.

צורה
מקופל
אתר פעיל
מתאים לסוכר
קצב
הכי מהיר
בערך 60 °C03
הכוס ב־60 מעלות: האנזימים נפרמו לשרשראות לבנות רפויות, והסוכרים נעים חופשי.

חם מדי

המשיכות החלשות שמחזיקות את הקיפול מתפרקות. השרשרת נפרמת, האתר מאבד את צורתו, והסוכר כבר לא נכנס אליו.

צורה
נפרם
אתר פעיל
איבד את צורתו
קצב
כמעט אפס
הרעיון הגדול

אנזים הוא זרז העשוי מחלבון: האתר הפעיל המקופל שלו מחזיק סוג אחד של מולקולה ומנמיך את המחסום של התגובה שלה. הוא פועל רק כל עוד הוא שומר על צורתו, ולכן חום עוזר עד גבול מסוים, ואז הורס אותו.

E + S → E + P

כימיה בטמפרטורת הגוף

הרוק מכיל אנזים, עמילאז, שמתחיל לפרק עמילן לסוכר כבר בזמן הלעיסה, ולכן לחם שמחזיקים בפה דקה מתחיל להיות מתוק. בהמשך מערכת העיכול, אנזימים אחרים מפרקים את הסוכרים האלה למולקולות גלוקוז בודדות שהגוף יכול לספוג. הכוס מראה את השלב האחרון הזה.

סוכר ומים לבדם היו מגיבים זה עם זה ב־37 °C רק אחרי זמן ארוך מאוד; אנרגיית השפעול גבוהה מדי. תאים לא יכולים פשוט לחמם את עצמם כדי לזרז את העניינים, ולכן הם משתמשים באנזימים: חלבונים שפועלים כזרזים. רבים מהם מאיצים את התגובה שלהם פי מיליונים ויותר. קטלאז, שמפרק את מי החמצן שהתאים מייצרים, יכול לטפל במיליוני מולקולות בכל שנייה.

כיס בצורה הנכונה

אנזים הוא שרשרת ארוכה של חומצות אמינו שמתקפלת לצורה תלת־ממדית מדויקת. אי־שם על פני השטח שלו יש שקע שנקרא האתר הפעיל. רק מולקולות בעלות הצורה והמטען המתאימים נכנסות אליו. בשנת 1894 השווה הכימאי אמיל פישר את ההתאמה הזאת למנעול ומפתח. מאוחר יותר הציע דניאל קושלנד שההתאמה דומה יותר ליד שנכנסת לכפפה: האתר משנה מעט את צורתו כדי להיסגר סביב המולקולה שלו, רעיון שנקרא התאמה מושרית.

כשהסוכר מוחזק באתר, הוא נמתח והקשרים שלו נמשכים בדיוק בזוויות הנכונות, וכך התגובה מקבלת דרך קלה יותר, עם מחסום נמוך יותר. שני החצאים משתחררים, האתר מתפנה שוב, והאנזים לוקח את המולקולה הבאה.

חם יותר, מהר יותר, עד גבול מסוים

חממו את הכוס, והמולקולות נעות ומתנגשות בעוצמה רבה יותר. יותר מהן מגיעות לאתרים הפעילים, וליותר מהן יש מספיק אנרגיה כדי להגיב, ולכן הקצב עולה. אבל הקיפול של האנזים מוחזק בזכות משיכות חלשות רבות בין חלקים שונים של השרשרת. כמה מעלות מעל טמפרטורת הגוף הן מתחילות להשתחרר, השרשרת נפרמת, והאתר הפעיל מאבד את צורתו. האנזים עובר דנטורציה, והקצב צונח. בישול ביצה עושה אותו דבר לחלבונים שבה: החלבון השקוף מתמצק ונעשה אטום.

נסו: בחרו מקרר, אחר כך חום הגוף, ואז אמבט חם, וצפו בכל אנזים מקופל נפרם לשרשרת חשופה. צפו בעקומת הפעילות בזמן שאתם עוברים ביניהם: הקצב עולה ואחר כך יורד. בחרו פועל תחת עמעום המים כדי לראות את האנזימים והסוכרים טוב יותר.

חזרה לניסוי

גם ה־pH חשוב

האחיזה של האתר הפעיל תלויה במטענים חשמליים, וה־pH משנה את המטענים האלה. לרוב האנזימים יש pH שבו הם פועלים הכי טוב. פפסין, שמעכל חלבונים בקיבה החומצית, פועל הכי טוב סביב pH 2; טריפסין, שממשיך את העבודה במעי הדק, מעדיף pH של כ־8. הרחיקו את ה־pH מ־7, ופחות סוכרים יישארו באתר מספיק זמן כדי להתפרק.

מה המודל הזה משאיר בחוץ

כל אנזים הוא הקיפול האמיתי של מלטאז אנושי, מתוך מבנה הגביש שלו, אבל מצויר כמשטח חלק: אלפי האטומים שמחזיקים את הסוכר בנקודות מגע מדויקות רבות אינם מוצגים, והסוכרים מצוירים גדולים בערך פי ארבעה כדי שאפשר יהיה לראות את האטומים שלהם. אנזים שנפרם מצויר כשלד החלבון החשוף שלו, באחת מכמה צורות רפויות ולא כסבך אמיתי. המודל פורם כל אנזים בטווח צר של טמפרטורות ומקפל אותו מחדש כשהוא מתקרר; אנזים אמיתי שחומם יותר מדי בדרך כלל מסתבך ונשאר חסר תועלת. עקומת הטמפרטורה היא צורה אופיינית לאנזים מגוף האדם, ואילו אנזימים של מיקרואורגניזמים ממעיינות חמים ממשיכים לפעול קרוב לנקודת הרתיחה.

04 / ללמוד את זה בקורס

תרגול, צעד אחר צעד.

השיעור הזה מלמד את הנושא עם שאלות שנבדקות.

  1. אנזימים ביולוגיה · מולקולות החיים