דנטורציה: מה חום שובר בחלבון ומה הוא משאיר, נקודת ההיתוך של חלבון, מוטציה אחת שמורידה אותה, וחלבון שעומד בחום של מעיין חם.
שלב 1 מתוך 5 · לחמם
שלב 1 מתוך 5
לחמם
הקיפול של חלבון מוחזק בהרבה קשרים חלשים: קשרי מימן (הנקודות בין גדילי המשטח ולאורך הסליל), משיכה בין מטענים הפוכים, והנטייה של השמנוניות להסתתר מהמים. כל אחד מהם חלש מאוד לעומת הקשרים הפפטידיים שמחזיקים את השרשרת עצמה, אבל יחד הם מחזיקים את הצורה.
שלב 2 מתוך 5
מה נשאר
כשחלבון מאבד את צורתו, אומרים שעבר דנטורציה. זה מה שקורה לחלבון הביצה כשמבשלים אותה: הוא היה שקוף ונוזלי, ונעשה לבן ומוצק, כי השרשראות הפרומות מסתבכות זו בזו. ובביצה, כמו בסצנה, דנטורציה בדרך כלל לא הפיכה.
שלב 3 מתוך 5
החלפה אחת
נקודת ההיתוך של חלבון היא הטמפרטורה שבה חצי מהמולקולות מקופלות וחצי פרומות. לחלבון הטבעי היא 60 °C. המוטנט זהה לו כמעט לגמרי: רק חומצת אמינו אחת, בלב המבנה (מסומנת בטבעת אדומה), הוחלפה. במקום שמנונית שהסתתרה במרכז יש טעונה, שאין לה מקום טוב שם.
שלב 4 מתוך 5
חום גבוה
בחום הגוף רוב המולקולות של המוטנט עדיין מקופלות. אבל המרחק שלו מנקודת ההיתוך קטן, וכל מעלה נוספת מורגשת.
שלב 5 מתוך 5
מעיינות חמים
יש חיידקים שחיים במעיינות חמים, ב־80 °C ויותר. החלבונים שלהם עושים אותה עבודה כמו שלנו, ומתקפלים לאותה צורה, אבל הם לא נפרמים בחום כזה. הטמפרטורה והחלבון פתוחים: השוו בין שלוש הגרסאות.
הגרסה האינטראקטיבית נטענת…
הגרסה האינטראקטיבית נטענת…
כל שלב מכין לכם את הסצנה, ובקר שמסומן „קבוע” נשאר במקומו בשלב הזה.
תרגול · נבאו, ואז הסתכלו
בחלבון המקופל, בחום הגוף, 28 קשרי מימן מחזיקים את הסליל ואת המשטח. נחמם אותו לרתיחה. כמה מהם יישארו?
תרגול · נבאו, ואז הסתכלו
בחלבון המקופל, בחום הגוף, 28 קשרי מימן מחזיקים את הסליל ואת המשטח. נחמם אותו לרתיחה. כמה מהם יישארו?
תרגול · חשבו
החלבון ברתיחה, פרום לגמרי. כמה קשרים פפטידיים נשארו בשרשרת של 56 חומצות האמינו?
תרגול · חשבו
החלבון ברתיחה, פרום לגמרי. כמה קשרים פפטידיים נשארו בשרשרת של 56 חומצות האמינו?
תרגול · הגיעו למטרה
זה המוטנט: חומצת אמינו שמנונית אחת בלב המבנה הוחלפה בטעונה. מצאו את הטמפרטורה שבה בדיוק חצי מהמולקולות שלו מקופלות, ולחצו על בדיקה.
תרגול · הגיעו למטרה
זה המוטנט: חומצת אמינו שמנונית אחת בלב המבנה הוחלפה בטעונה. מצאו את הטמפרטורה שבה בדיוק חצי מהמולקולות שלו מקופלות, ולחצו על בדיקה.
תרגול · חשבו
למוטנט יש חום של 41 °C. איזה אחוז מהמולקולות שלו עדיין מקופלות? קראו מהגרף.
תרגול · חשבו
למוטנט יש חום של 41 °C. איזה אחוז מהמולקולות שלו עדיין מקופלות? קראו מהגרף.
תרגול · בחרו
הגרסה אוהבת חום באה מחיידק שחי במעיין חם. ב־80 °C היא עדיין מקופלת. מה מחזיק אותה?
תרגול · בחרו
הגרסה אוהבת חום באה מחיידק שחי במעיין חם. ב־80 °C היא עדיין מקופלת. מה מחזיק אותה?
השיעור הושלם. עניתם על כל שאלות התרגול בו.
